تفضل أمير المؤمنين، جلالة الملك محمد السادس، حفظه الله، بتشييد هذا المسجد، من ماله الخاص وأطلق عليه اسمه الشريف.
يعتبر مسجد محمد السادس بمدينة المضيق معلمة تعطي نموذجا يعكس الطراز المعماري المغربي الأصيل في عمارة المساجد، ويراعي خصوصيات وألوان البناء المحلي الذي يزيدها بهاء وجمالا.
